Die Zusammenarbeit mit dem israelischen Forschungsministerium (MOST) konzentrierte sich im Rahmen des vom Bundesministerium für Bildung und Forschung (BMBF) geförderten Programms LASER 2000 auf Grundlagen für neue Lasergenerationen und die Erschließung neuer Anwendungsfelder. Das Programm begann 2000 und hatte einen Schwerpunkt in der Entwicklung ultraschneller Laser (Femtosekunden-Technologie). 2004 fand eine Neuausrichtung der Kooperation statt mit dem Ziel, Unternehmen der gewerblichen Wirtschaft bei Forschungs- und Entwicklungsvorhaben zu unterstützen.

Gegenwärtig erfolgt die Kooperation in der Photonik im Rahmen der Europäischen Technologieplattform Photonics21, an der sich Israel beteiligt.