Die VolkswagenStiftung unterstützt seit ihrer Gründung im Jahre 1961 in vielfältiger Weise die Forschungskooperation zwischen Israel und Deutschland. Im Rahmen des Forschungsförderprogramms zukunft.niedersachsen des Landesministeriums für Wissenschaft und Kultur, fördert die Volkswagen-Stiftung seit 1977 mit jährlichen Ausschreibungen niedersächsisch-israelische Projekte. Vorrangige Partner in Israel sind die Hebräische Universität Jerusalem und das Technion in Haifa.
Im Mittelpunkt der Israelaktivitäten der Bertelsmann-Stiftung stehen die Begegnung und der Austausch zwischen jungen Führungskräften. Dazu wurde im Jahr 2000 der Deutsch-Israelische Young Leaders Exchange ins Leben gerufen mit dem Ziel, den zukunftsorientierten Dialog und die Kooperation zwischen jüngeren deutschen und israelischen Führungskräften zu initiieren und zu begleiten. Darüber hinaus kooperiert die Bertelsmann Stiftung mit dem Deutsch-Israelischen Zukunftsforum.
Die Fritz Thyssen Stiftung wurde 1959 gegründet und ist die erste große private wissenschaftsfördernde Einzelstiftung, die nach dem Zweiten Weltkrieg in der Bundesrepublik Deutschland errichtet wurde. Die Stiftung bietet Stipendien- und Austauschprogramme mit israelischen Institutionen, fördert Projekte israelischer Forscher sowie wissenschaftliche Veranstaltungen in Israel und die Beteiligung israelischer Forschender an Aktivitäten in Deutschland. Der Förderschwerpunkt liegt im Bereich der Geisteswissenschaften.
Die Heineman-Stiftung vergibt jährlich zwei Stipendien an junge Forschende an Max-Planck-Instituten und am israelischen Weizmann Institute of Science. Gefördert werden die Bereiche Biologie, Medizin und Biomedizin. Jedes der beiden Stipendien umfasst 80.000 Euro. Zudem wird jährlich der James Heineman Preis an eine oder einen junge/n Forschende/n an einem Max-Planck-Institut oder am Weizmann Institute of Science verliehen. Der Preis ist mit 60.000 Euro dotiert.
Die ZEIT-Stiftung Ebelin und Gerd Bucerius in Hamburg konzentriert sich bei ihrer Wissenschaftsförderung in Israel auf die Universität Haifa. Das dort von ihr gegründete Bucerius Institute for Research of Contemporary German History and Society ermöglicht längere Forschungsaufenthalte für den wissenschaftlichen Nachwuchs sowie für Gastprofessorinnen und Gastprofessoren.
Über die Aktivitäten deutscher Stiftungen informiert auch der Bundesverband Deutscher Stiftungen.
